Paysage karstique
Le secteur du Parc est caractérisé par la prédominance des calcaires mésozoïques avec insertions dolomitiques, et des dolomites eux-mêmes. Le rapport entre les couches dolomitiques peu perméables ou étanches et les couches calcaires du Jura et de la craie perméables a déterminé les traits du relief de tout cet espace. Les propriétés hydrogéologiques spécifiques des roches ont permis la rétention d’eau sur les roches dolomitiques d’âge triasique, mais aussi l’incision du canyon dans les couches du calcaire crétacé. C’est la raison pour laquelle le système des lacs est divisé en lacs supérieurs et lacs inférieurs. Les lacs supérieurs dominent du point de vue de l’espace et du volume, sont formés sur les couches de dolomite, sont plus spacieux, plus dentelés et dotés de pentes plus douces que les lacs inférieurs, et comprennent : Prošćansko jezero, Ciginovac, Okrugljak, Batinovac, Veliko jezero, Malo jezero, Vir, Galovac, Milino jezero, Gradinsko jezero, Burgeti et lac Kozjak. Les lacs inférieurs sont formés dans l’étroit canyon calcaire aux pentes abruptes, et comprennent les lacs Milanovac, Gavanovac, Kaluđerovac et Novakovića Brod. Les lacs Kozjak et Prošćansko jezero sont les lacs les plus spacieux. La formation des lacs est due aux barrières de travertin, et l’on estime que le système des lacs serait créé il y a 12.000 à 15.000 ans.
Sites souterrains
Dans le secteur du Parc, 114 sites spéléologiques ont été enregistrés jusqu’à présent. Ce chiffre inclut également les sites en bordure (et en dehors) du Parc, qui se trouvent à 500 m de distance par rapport à ses frontières officielles. Les gouffres représentent le type de site spéléologique dominant dans le secteur du Parc. Sur 114 sites spéléologiques, il y a 82 gouffres (72 %) et 32 grottes (28 %), c’est-à-dire sites horizontaux. Selon les dimensions, les sites plus petits (moins de 50 m de profondeur ou de longueur) sont les plus nombreux (91). Les sites spéléologiques de dimensions moyennes (entre 50 et 500 m de profondeur ou de longueur) sont au nombre de 23 (20 %). La longueur totale des sites explorés jusqu’à présent est de 1 664 m, et la profondeur totale de 2 251 m. Des sites spéléologiques de grandes dimensions, dont la longueur ou la profondeur dépasserait 500 m, ne sont pas connus jusqu’à présent.
Du point de vue morphologique, les sites les plus importants sont : le gouffre Čudinka (-203 m) et le gouffre de Vršić (-154 m, d’une longueur de 110 m). Le gouffre Čudinka est particulièrement intéressant dans la mesure où tout le site est composé d’une seule cavité verticale spacieuse, qui était longtemps l’une des plus profondes en Croatie. A côté des gouffres mentionnés, les grottes qui se distinguent par leurs dimensions dans le secteur des lacs de Plitvice sont – Mračna špilja (160 m), Golubnjača (145 m) et Špilja vile Jezerkinje (104 m), ainsi que la grotte Golubnjača dans la vallée de Homoljac (153 m). La grotte de la fée Jezerkinja (Špilja Vile Jezerkinje), la grotte Šupljara et la grotte Golubnjača sont depuis l’an 1964 classées monuments naturels géomorphologiques. Dans la grotte de Rodić près de la vallée Sertić Poljana et dans la grotte Mračna špilja près des lacs inférieurs, le squelette de l’ours des cavernes a été retrouvé, si bien qu’il s’agit de deux sites paléontologiques importants. Les dernières recherches systématiques des sites spéléologiques dans le secteur du Parc national des lacs de Plitvice datent des années soixante du siècle dernier et sont considérées comme recherches préliminaires.